PEMARF 2021 - online!

Prezados,

Iniciaremos nossos estudos no dia *13 de setembro*, as 8:00 da manhã.

Esta é uma disciplina introdutória que visa dar um amplo entendimento dos conceitos envolvidos na reconstrução histórica a partir de dados moleculares. A disciplina é teórica e enfatizará a descoberta e compreensão de temas fundamentais para estudos filogenéticos moleculares. Existe adicionalmente um forte enfoque no desenvolvimento das habilidades: leitura, escrita, apresentação oral e discussão acadêmica. Ao final da disciplina, é esperado que os alunos tenham:

1. produzido numerosos textos curtos de qualidade,
2. produzido um curto produto de mídia para divulgação científica,
3. realizado a leitura e discussão cuidadosa de textos essenciais na área.

A disciplina aborda temas teóricos fundamentais de evolução molecular para sua aplicação em reconstruções históricas. A evolução molecular é disciplina desenvolvida ao longo de décadas e que possui um arcabouço de conceitos e ideias que não são necessariamente bem difundidos entre aqueles que aplicam seus métodos com o objetivo de criar reconstruções filogenéticas, e por consequência classificações e inferências evolutivas. Esta disciplina busca fornecer um fundamento introdutório para estudantes do programa de PG Zoo, e outros programas relacionados.

A disciplina é indicada para estudantes que tenham pouca familiaridade com evolução molecular, porém com conhecimento sobre sistemática filogenética. É indicada também àqueles estudantes cujos projetos não envolvem filogenias moleculares, porém querem ter conhecimento acadêmico sobre o assunto para facilitar a leitura e diálogo com esta disciplina fundamental. A disciplina é teórica e não enfatizará métodos de reconstrução, nem treinará a utilização de softwares específicos.

Organização do curso online

O curso está organizado em 16 dias, sendo 12 dias de aulas e 4 dias de avaliações. Este curso segue uma estrutura bastante distinta do que os estudantes estão geralmente acostumados. É imperativo que você leia estes esclarecimentos, pois nem todas as pessoas vão conseguir se adaptar ao formato. Ao final destes esclarecimentos, o estudante deve entender que para obter conceito A na disciplina, recomenda-se a presença em TODAS as aulas, e obrigatoriamente a entrega de TODAS as avaliações. A falta em mais de duas aulas dificultará imensamente a obtenção de conceito A, pois depende de muita dedicação e consistência. Adicionalmente, o formato da disciplina pode não ser adequado para todos. Portanto, cuidado com viagens de campo, conferências etc. A data limite para "des"matricula na disciplina é dia 19 de setembro de 2021.

O calendário para 2021 segue.

Organização da Aula

Cada aula explora um grande tema de evolução molecular, que é fundamental em sua aplicação na reconstrução histórica. A estrutura de aula enfatiza conhecimento biológico, lógica, leitura, e formalização de raciocínios abstratos na forma de escrita científica. A agenda de cada aula é, com exceção da Aula 1:

Todas aulas se iniciarão com um apresentação sobre os conceitos canônicos do assunto, em formato de curta aula gravada online, feita pelo docente, sobre os aspectos canônicos do assunto em questão. Os estudantes devem assistir esta aula individualmente, realizando anotações e consultando a bibliografia recomendada para a aula (essencial!). Para cada aula, existe um conjunto de artigos para leitura recomendados, e pelo menos um obrigatório, disponíveis na página Literatura. O horário sugerido para esta atividade é das 8:00-9:00.

Seguindo esta apresentação geral, haverá um momento de discussão, realizada de maneira síncrona utilizando a plataforma Discord (à princípio). Espera-se que neste momento sejam resolvidas e discutidas as questões centrais baseando-se na literatura recente. O horário será das 9:00 as 10:00 para esta atividade.

Em seguida, os estudantes devem se organizar em grupos e trabalhar na escrita científica (ou vídeo), de acordo com o cronograma semanal de tarefas. Cada dia possui um objetivo a ser cumprido. Esta tarefa deve ser realizada de maneira conjunta utilizando a plataforma Discord e o site Wiki, exceto na última semana que é individual (porém o debate é estimulado para quem estiver interessado, a plataforma ficará disponível). O horário para execução é das 10:00 as 11:00.

A partir das 11:00, o professor visitará cada grupo na plataforma Discord para discutir os progressos e debater sugestões.

Tarefas Escritas e Vídeo

Um dos objetivos desta disciplina é aproximar o estudante da escrita científica. Portanto, em cada aula, cada estudante deverá ter trabalhado na direção de produzir material escrito (ou mídia, na terceira semana) relativo ao assunto discutido no dia. Este texto não deve abranger todo o assunto discutido, pelo contrário, deve se fixar em apenas um aspecto e apresentar as características de um bom texto científico: ser sucinto, claro e objetivo. Durante as primeiras 3 semanas, este exercício será realizado em grupos de 3 pessoas, e na última semana, será realizado individualmente.

O último dia de cada semana é dedicado ao trabalho e finalização destes textos. Os textos devem ser entregues até as 12:00 (meio dia) da quinta-feira impreterivelmente. Estes textos serão produzidos e publicados online, dentro do contexto deste site WIKI que será produzido pelos próprios alunos — em páginas de grupos e também cada um com sua própria página pessoal.

Cada semana explorará, de maneira progressiva, desafios mais complexos da comunicação científica, de acordo com o cronograma acima.

Vídeos

Ao invés de seminários, neste ano cada grupo produzirá vídeos durante a terceira semana da disciplina. Os vídeos devem possuir no máximo 1 minuto de duração, devem ser embebidos na página do grupo no site wiki (pode ser uppado no youtube ou qualquer outro, desde que esteja disponível para visualização na página tbm). A metodologia de produção deste conteúdo é completamente livre. No entanto, os preceitos de escrita científica se aplicam 100% a esta atividade.

Avaliações

A avaliação é contínua, consistindo de 4 elementos a serem entregues semanalmente:

1. um parágrafo ao final da primeira semana (em grupo)
2. um mini-ensaio ao final da segunda semana (em grupo)
3. uma produção midiática de 1 minuto ao final da terceira semana (em grupo)
4. um texto individual a partir de tema sorteado ao final da quarta semana

Não serão oferecidas provas de recuperação, nem substitutiva — caso o aluno perder uma das avaliações, a resolução será feita caso-a-caso, desde que exista justificativa comprovada para a ausência (atestado médico, etc).

As avaliação final consiste de ensaio escrito sobre um tema, seguindo o modelo de concurso público. Na semana anterior, será divulgado em aula e no site uma lista de 5 à 10 pontos baseada nas discussões feitas em sala de aula. No dia 1 da última semana, será realizado o sorteio de um ponto. Os estudantes terão então até a quinta-feira, dia 7 de outurbo ao meio-dia para entregar o estudo completo. Expectativas do ensaio:

1. Devem ser escritos de acordo com conceitos sobre escrita científica discutidos em sala.
2. Devem ser entregues preferencialmente em inglês, porém podem também ser entregues em português sem prejuízo. Não podem ser entregues em espanhol.
3. Devem conter referências.
4. Devem ter no máximo 1500 palavras.
5. Devem ser utilizados recursos de ilustração, links externos, vídeos, etc.

Composição final da nota

A nota será composta da seguinte maneira, totalizando o valor 10:

6. Segundo as regras da PRPG-USP, a avaliação é dada na forma de conceitos (A, B, C ou R). A transformação das notas para esta disciplina seguirá a seguinte fórmula: